با انتقال دانشگاه و دانشکده‌ها از سطح شهر به طرح جامع (مکان کنونی دانشگاه) در اویل دهه 1380، کتابخانه دانشکده علوم پایه با بیش از 10 هزار نسخه کتاب در مجموعه کتابخانه مرکزی دانشگاه ادغام گردید. این کتابخانه در سال 1390 و به‌منظور ارائه خدمات و پویاسازی فضای پژوهشی دانشکده، مجدد راه‌اندازی شد و به‌تدریج و باسیاست‌های مدیریت مجموعه، با 11000 نسخه کتاب فارسی و انگلیسی به یکی از بروزترین کتابخانه‌های دانشکده‌ای در سطح کشور تبدیل‌شده است.

نرم‌افزار کتابخانه Digilib نسخه ویندوز شرکت پارس آذرخش می‌باشد و همچنین کتابخانه مجهز به پورتال کتابخانه دیجیتال می‌باشد که کلیه اعضا کتابخانه می‌توانند شخصاً جهت ثبت‌نام در پورتال کتابخانه، عضویت در کتابخانه، رؤیت مدارک امانتی، رزرو، تمدید مهلت کتب امانتی و بارگذاری فایل پایان‌نامه اقدام نمایند.