دانشکده علوم پایه، فعالیت رسمی خود را از سال 1369 با هدف تربیت نیروهای متعهد و متخصص در گروه ریاضی برابر مجوز وزارت علوم تحقیقات و فناوری آغاز نموده و با تشکیل گروه زیست شناسی در سال 1372 و گروه فیزیک در سال 1379 فعالیت خود را در مقطع کارشناسی گسترش داد. بعلاوه از سال 1385 با پذیرش دانشجو در رشته ریاضی کاربردی و علوم جانوری گرایش فیزیولوژی در مقطع کارشناسی ارشد و در سال 1387 با پذیرش دانشجو در رشته میکروبیولوژی در مقطع دکتری فعالیت خود را افزایش داد.
این دانشکده تاکنون 22 دوره دانشجو از طریق سازمان سنجش و آموزش کشور پذیرفته و 17 دوره فارغ التحصیل داشته است.